錳砂濾料的工作原理是鐵以Fe2+的狀態曾于地下（井）水中，水會有異色和異味，從而會降低污染離子交換樹脂的能力，長時間它會形成腐蝕設備的鐵垢，而且影響傳熱。而錳砂濾料中的MnO2與Fe2+會發生氧化還原反應，將會使Fe2+變為Fe3+并生成 Fe(OH)3的沉淀，去除凈化的目的就是利用錳砂過濾器的反沖洗功能所達到的。如果含有鐵和錳的水長期通過濾料表面時，它在濾料表面就會形成鐵質和錳質濾膜。因為該性濾料對鐵、錳的吸附能力很強，所以在經過該性濾料時就可以縮短鐵質、錳質濾膜的形成時間，如果是在自然條件下形成的鐵質濾膜那么就會需要很長的時間，形成錳質濾膜的時間也會更久。一般因為所形成的鐵質濾膜和錳質濾膜對去除鐵和錳都具有催化的作用，所以我們稱之為“活性濾膜”。

        天然的錳砂濾料是用于地下水除鐵和除錳的，氧化錳是以錳的形態為主。它的含錳量一般不會小于35%的天然錳砂濾料，它既可以用于地下水處理中除鐵，也可用于地下水處理中除錳；假如是含錳量為20%～30%之間的天然錳砂濾料，那么它就會只適合用于地下水中除鐵；如果是含錳量小于20%的錳礦砂是不宜采用的。所以在使用時應優先采用經過科學試驗的錳砂濾料或者是具有良好的除鐵和除錳生產效果使用證明的天然錳砂濾料產品。

        在使用過程中天然錳砂濾料的鹽酸可溶率不能大于3.5%（百分率按質量計，下同），破碎率和磨損率之和不能大于3%。而且不能含有肉眼可見泥土、頁巖和外來碎屑，含泥量不能大于2.5%。天然錳砂濾料在使用中如果對密度沒有特殊要求的，它的平均密度一般為3.2g/cm3至3.6g/cm3范圍內。